Veterinaar- ja Toiduamet hindab ja kontrollib toetuse taotlejat järgmiste teemade lõikes:
Kohustuslikud majandamisnõuded KM 6-8: Loomade identifitseerimine ja registreerimine - VTA kohapealne kontroll KM 10: Hormoonide kasutamine loomakasvatuses KM 11: Toidu ja söödaohutus KM 12:TSE KM 13-15: Loomahaigustest teatamine, alates 2011